Conan Edogawa viaja a Singapur, concretamente a la famosa Marina Bay Sands, escenario en el que se ha producido un cruento asesinato. La investigación de Conan parece girar en torno a una gema legendaria conocida como "el Zafiro Azul", que lleva sumergido en el océano desde finales del siglo XIX. Makoto Kyôgoku, un maestro de karate, ayudará al joven detective a detener a Kaitō Kid, quien quiere robar la tan preciada joya.