Al final del siglo XXI, el mundo está plagado de un misterioso virus y un clima inusual. El Dr. Kisaragi crea un androide con el nombre código ¨Cutie Honey¨ (Mariya Nishiuchi). El androide es único, ya que posee las emociones humanas. Para salvar a la humanidad, Cutie Honey va en contra de una organización maligna.